ＣＳＩ：ニューヨーク6のあらすじ一覧
最終回 脱獄囚シェーン（エドワード・ファーロング）が逮捕されるが、再び脱走する。シェーンがバーに残したドクロの描かれた紙幣が見つかり、絵の謎に挑むCSI。一方、ダニー（カーマイン・ジョビナッツォ）とリンジー（アンナ・ベルナップ）は、娘を連れてロングアイランドへ休暇に向かう。
自宅療養中のマック（ゲーリー・シニーズ）は、窓から向かいのアパートの住人を観察して過ごす。そんな中、飲食店のトイレで、身元不明の男性が鼻血を出して死んでいるという事件が発生。マックは、その男性が向かいのアパートの1室を訪れていたことを思い出す。
マック（ゲーリー・シニーズ）が食事をしていると、近くで発砲事件が発生。被害者は中学生ぐらいの少年で、そばには弟がいた。弟の話では、何者かが突然現れて兄を撃ち、父の形見の時計を奪って逃げたという。しかし、現場からは銃は発見されるが銃弾は見つからない。
コンクリートから血が噴き出し、男の死体が見つかる。掘り出された死体は奇妙な装いをしていて、死因は窒息死だった。また、爪からは麻薬使用の痕跡があり、手にはボクサー特有のけがもあった。マック（ゲーリー・シニーズ）は男の身元を割り出すため奔走する。
女性の死体が遺体安置所に運ばれ、自殺と断定されるが、ステラ（メリーナ・カナカレデス）は異論を唱える。そんな中、CSIに被害者の衣類を届けに来た女医から、被害者の左手が不自然に硬直していたと聞いたマック（ゲーリー・シニーズ）は、抵抗の証と判断し捜査を再開する。
女性の死体が遺体安置所に運ばれ、自殺と断定されるが、ステラ（メリーナ・カナカレデス）は異論を唱える。そんな中、CSIに被害者の衣類を届けに来た女医から、被害者の左手が不自然に硬直していたと聞いたマック（ゲーリー・シニーズ）は、抵抗の証と判断し捜査を再開する。
倉庫で二人の男性の死体が発見される。頭を撃たれた一人の身元は記者・ペイリー（チャド・ゲレロ）と判明したが、撲殺されたもう一人は分からない。また、現場では4組の靴跡と、床の衝撃痕から純金の痕跡が見つかるが、凶器の銃は何者かに持ち去られていた。
血まみれの男・ジェームズ（ジョー・リーガン）がおのを振り回して拘束された。ジェームズがいたホテルの部屋からは、彼の友人4人の遺体が発見された。ジェームズには薬物反応があり、彼の犯行かと思われたが、血痕やDNAの捜査の結果、犯人は他にいると判明する。
公園で若い女性の死体が発見される。首を刺されたことによる失血死だったが、手首に妙な傷あとが見つかる。容疑者として浮かんだ男にも同様の傷あとがあり、さらにマック（ゲーリー・シニーズ）は、殺害された女性の父親の手首にも同じ傷あとがあることに気付く。
公園で若い女性の死体が発見される。首を刺されたことによる失血死だったが、手首に妙な傷あとが見つかる。容疑者として浮かんだ男にも同様の傷あとがあり、さらにマック（ゲーリー・シニーズ）は、殺害された女性の父親の手首にも同じ傷あとがあることに気付く。
ランジェリー・フットボールチームに所属する女性の死体が、ロッカールームのバスタブで発見される。検視の結果、死因は呼吸不全と判明。検視官のシド（ロバート・ジョイ）は、半年前に突然死した別の選手の検視を追及していれば、今回の事件を防げたのではと気に病む。一方、検視官のシェルドン（ヒル・ハーパー）は、現場のゴミ箱から注射器を発見する。
女性を刺殺したとして男が起訴されるが、ステラ（メリーナ・カナカレデス）は法廷で、証拠の問題点を指摘し、男は保釈される。しかし、彼には動機も、現場から立ち去る姿の目撃証言もあった。証拠に問題があるとした背景には、担当検事補が、妻の浮気相手を突き止めるために、浮気相手の男のライターを犯行現場に置いたというねつ造行為があった。
車でひかれた形跡と薬物反応のある男性の死体が発見された。ステラ（メリーナ・カナカレデス）は男性の婚約者から、現在は薬物を完全に絶っていたと聞く。その後、犯行に使われた車の持ち主が連行される一方で、男性に巨額の保険金が掛けられていたことが判明する。
911番に助けを求める緊急通報が入り、フラック（エディ・ケイヒル）らCSIはペントハウスへ急行。するとそこにはミイラ化した男の死体が。ミイラは30年前に死亡したペントハウスの所有者かと思われたが、義歯の特徴などから、ミイラの死亡時期が約86年前と分かる。
姿を消した”コンパス・キラー”ホリス（スキート・ウーリッチ）が、下水道トンネルに逃げたことが判明。CSIはトンネル内を捜索し、ホリスの隠れ家を発見する。そんな中、ダニー（カーマイン・ジョビナッツォ）らは怪しい男を捕まえるが、ホリスが用意した身代わりだと分かる。
ファンド会社を解雇された男性がかつての仕事仲間を射殺し、川に落ちて死亡する。自殺と思われたが、マック（ゲーリー・シニーズ）らCSIの調べで胸を撃たれていたことが判明。さらに、川底から針の固定されたコンパスが発見され、コンパス・キラーの犯行だと気付く。
ホテルのスイートルームでストリートダンサーの女性が射殺される事件が発生。被害者の友人・ブルック（ラクエル・アレッシ）も頭を殴られ、事件当日の記憶を失ってしまう。その後、CSIのフラック（エディ・ケイヒル）は、被害者が以前にも強盗に遭っていることに気付く。
ホテルのスイートルームでストリートダンサーの女性が射殺される事件が発生。被害者の友人・ブルック（ラクエル・アレッシ）も頭を殴られ、事件当日の記憶を失ってしまう。その後、CSIのフラック（エディ・ケイヒル）は、被害者が以前にも強盗に遭っていることに気付く。
ホテルのスイートルームでストリートダンサーの女性が射殺される事件が発生。被害者の友人・ブルック（ラクエル・アレッシ）も頭を殴られ、事件当日の記憶を失ってしまう。その後、CSIのフラック（エディ・ケイヒル）は、被害者が以前にも強盗に遭っていることに気付く。
デボラ（ミア・カーシュナー）という女性が「夫を殺した」と自首する。警察がデボラの自宅へ行くと、供述通り夫の刺殺体が見つかる。だが、凶器のナイフからは別の女性のDNAが検出。マック（ゲーリー・シニーズ）らは、デボラが誰かをかばっているのではないかと疑う。
