シーズン1では、ニューヨークで若い女性が殺され、「FBI:特別捜査班」の主人公・マギー(ミッシー・ペリグリム)とOA(ジーコ・ザキ)が捜査に当たっていた。事件の背景に性的人身売買の実態が浮上したことから、「FBI:Most Wanted~指名手配特捜班~」でお馴染みのラクロイ(ジュリアン・マクマホン)のチームも捜査に加わるが、容疑者はクロアチアへ逃亡してしまう。そこで、ブダペストを拠点とする“フライチーム”が捜査を引き継ぐことに――。
シーズン2では、アメリカ人刑事が殺されたフランスのパリをはじめ、スペインのマジョルカ島、トルコのイスタンブール、ルーマニアのブカレストなどの事件を“フライチーム”の捜査官たちが調査する。ちなみにシーズン2第16話は、「FBI:特別捜査班」シーズン5、「FBI:Most Wanted~指名手配特捜班~」シーズン4へとつながるトリプル・クロスオーバー・エピソードの序章となっている。
フライチームに数々の脅威が迫り、緊張感のあるシーンも盛りだくさんな「FBI:インターナショナル」。動画配信サービス・Huluでは、現在シーズン1、2を見放題配信中だ。
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