このたびHuluで配信が開始したシーズン5では、第6話からマギーが復帰。また最終話となる第22話は、シリーズ通算100話に達するという記念すべきシーズンとなっている。
同シーズンでは、強力な爆薬・C-4が闇取引現場から強奪されるという事件が発生。FBIニューヨーク支局のメンバーは爆薬の行方を捜査する。その後も、質店で店主と市警の刑事が射殺される事件や、女性をターゲットにした連続殺人事件などに挑んでいく――。
また、チームリーダー・ジュバル(ジェレミー・シスト)が元妻との間の息子の大病に悩んだり、スコーラとニーナの関係が進展したりと、捜査官たちのプライベートも見どころとして描かれる。
さらに第16話は、「FBI:インターナショナル」シーズン2第16話、「FBI:Most Wanted ~指名手配特捜班~」シーズン4第16話との“2度目のトリプル・クロスオーバー”となっている。
Huluでは、「FBI:特別捜査班」シーズン1~5まで全話見放題配信中。
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