ブラッディ・マンデイのあらすじ一覧
誘拐された真子（徳永えり）を助けるべく、藤丸（三浦春馬）と竜之介（田中哲司）がもみ合いに。ところが、転がった銃を拾った真子は、銃口を藤丸に向け、実はテロリストの一味であることが判明する。そんな中、THIRD-I（サードアイ）が突入。Kの正体や竜之介の裏切りの理由、テロリストたちの真の目的といった謎が次々と明らかにされる。
J（成宮寛貴）は、自分と音弥（佐藤健）が兄弟であることを藤丸（三浦春馬）に明かした。がく然とした藤丸は、度重なる音弥からの電話を思わず無視してしまう。そんな中、マヤ（吉瀬美智子）がTHIRD-I（サード・アイ）に出頭。マヤは、THIRD-Iに協力すると話し、高木（田中哲司）がJの兄弟であるKの正体を知った真子（徳永えり）を誘拐したと明かす。
神島（嶋田久作）の拘置されている独房にウイルスがまかれた。神島は、マヤ（吉瀬美智子）たちに連れられて独房を脱出。加納（松重豊）は、逃走する神島を追いかけようとするがマヤにキスされ、ウイルスに感染する。一方、藤丸（三浦春馬）はウイルスに感染した英（久野雅弘）の死を自分のせいだと思い、落ち込んでいた。
学校を訪ねた藤丸（三浦春馬）たちは、J（成宮寛貴）の策略によってウイルスに感染し、テロリストに拘束される。マヤ（吉瀬美智子）は、霧島（吉沢悠）に抗ウイルス剤が欲しければ、神島（嶋田久作）を釈放するようにと告げる。実は抗ウイルス剤を保有している霧島は、マヤたちにばれないように藤丸に与える作戦を企てる。
藤丸（三浦春馬）は、抗ウイルス剤を発見するために、高木（田中哲司）のパソコンを調べる。その中で高木が敷村（神保悟志）に貸していたコテージの画像を見つけた藤丸は、加納（松重豊）たちとコテージを訪ねる。藤丸たちは、コテージで抗ウイルス剤を見つけるが、マヤ（吉瀬美智子）らテロリストがコテージを取り囲む。
研究所に着いた藤丸（三浦春馬）は、システムをハッキングする。倉庫の監視カメラの映像を見た藤丸は、敷村（神保悟志）がマヤ（吉瀬美智子）に銃を突き付けられていると気付く。敷村は、マヤとある約束を交わし、逃走。敷村と合流した藤丸は一緒に逃げようとするが、そこへ現れた高木（田中哲司）が銃口を向けてくる。
マヤ（吉瀬美智子）にファミレスに連れていかれた藤丸（三浦春馬）は、J（成宮寛貴）と対面した。Jは、藤丸に仲間になるように迫るが、マヤの携帯の電波を追っていたTHIRD-Iがファミレスを包囲。Jは、逃がしてくれるならウイルスに感染した人物を救う方法を教えるから、霧島（吉沢悠）に交渉するようにと藤丸に告げる。
藤丸（三浦春馬）はテロリストだった宝生（片瀬那奈）から、遥（川島海荷）の命が欲しければ裏切り者は加納（松重豊）だったとTHIRD-Iに報告するように迫られた。藤丸は、渋々、霧島（吉沢悠）にそれを告げる。そんな中、宝生はTHIRD-Iに潜入し、起爆装置を設置。監視カメラでそれを目撃した霧島はがくぜんとする。
Third-I（サードアイ）は藤丸（三浦春馬）を殺そうとしたマヤ（吉瀬美智子）を銃撃し、捕獲。本部へと連れて帰り、テロの詳細を聞くため、拷問を始める。そんな中、ウイルスについて調べる敷村（神保悟志）が出門（TET）に誘拐される。監視カメラの映像から高木（田中哲司）が出門と組んでいる疑惑が浮上し、加納（松重豊）たちは驚く。
THIRD-I（サードアイ）に「ウイルスをある女性に送った」と連絡が。電話の人物の目的が藤丸（三浦春馬）の身柄と知った加納（松重豊）は、藤丸を確保するように指示を。一方、藤丸は遥（川島海荷）をさらった犯人から電話でTHIRD-Iのパソコンに入った“クリスマスの虐殺”のデータを消すように迫られ、ハッキングを行う。
天才ハッカーとテロ組織との闘いを描く。ロシアの町で人々がいなくなる事件が発生。真相を探る警視庁の秘密部隊「THIRD-I（サードアイ）」は、ロシア軍事施設のコンピューターのハッキングを、天才ハッカーで高校生の藤丸（三浦春馬）に依頼する。解析に成功した藤丸は、殺人ウイルスで人々が死んでいく映像を目撃する。
