名探偵コナン

警視庁交通部の橙子、紫織が立て続けに殺害された。佐藤刑事らは現場付近の聞き込みで、1週間前に別の事件があったことを知る。そこへ交通課の由美が現れ、「駐車禁止の標識」がダイイングメッセージではないかと助言する。一方、現場でコナンは千葉刑事から捜査状況を聞き出し、ある事に気付く。

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警視庁交通部の橙子（とうこ）が遺体で発見される。事件は1週間前、橙子と紫織が交通違反の取り締まりで口論になった3人の男性の関与が疑われる。そんな中、今度は紫織が襲われる。一方コナンは、1週間前に交通違反の取り締まりが行われた現場近くにある、喫茶ポアロで安室に聞き込みをしていた。

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コナンらは通学の途中で交通課の三池苗子と出くわす。苗子はコナンらに交通ルールを教えながら一緒に学校へ向かう。その後、苗子はなかなか進展しない千葉刑事との恋愛に悩み、憂さ晴らしに同僚の紫織、橙子とカラオケに行く。帰り道、一人になった橙子は、不審な男に声を掛けられる。

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コナンらは旅行先の金沢で誘拐事件に巻き込まれる。だが、それは被害者である元友禅作家・学の自作自演だったことが判明。しかし、学の雇い主の林が襲われるという新たな事件が起きる。さらにマリの元には、容疑者の学からマリの弟子である凛太朗を誘拐したと脅迫電話がかかってくる。

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コナンは蘭、小五郎と金沢旅行にやって来る。3人が金沢を満喫していると、不審な行動を取る女性・マリと出会う。マリは何者かに誘拐事件の身代金受け渡しを指示されていた。その後、人質は解放されたが、コナンは犯人がマリの行動範囲を知っていたことから、知人の可能性があると考える。

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恩田、末村を爆殺した犯人は亡くなった米倉だった。動機は10年前の4人組による強盗事件。米倉は恩田からゆすられ、かつての仲間全員の殺害を計画。だが、さらに5人目の強盗犯がいた事が判明し、コナンと平次は米倉がもう一人も殺害するため、どこかに爆弾を仕掛けていると確信する。

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爆弾を使って3人の命を狙った容疑者として、かつて被害者たちと自主映画上映会に参加していた石澤が浮上する。大滝警部らは石澤の自宅へ踏み込むが、そこで監禁された石澤を発見。自宅から爆弾は見つからず、コナンは石澤の自宅を調べ、平次は京都で殺害された恩田について調査する。

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コナンと平次が犯人と見破った高内と三原は、米倉の車で逃走するが、直後に車が爆発。運転していた高内は即死する。一方、京都府警の綾小路警部は、脚本家の恩田が車で転落死した事故を捜査。綾小路は恩田と米倉の接点を突き止めるが、さらに爆発事件が起きて新たな犠牲者が出てしまう。

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4週にわたり、アニメオリジナルエピソードを放送。コナンらは映画の制作発表会に招待され、大阪にやって来る。制作発表中、プロデューサーの米倉が倉庫で怪獣フィギュアの下敷きになり、絶命する事故が発生。だが、フィギュアを支えるロープが切られており、大滝警部は事件と判断する。

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コナンは、小五郎の講演会で起きた2つの殺人事件を解決に導いた、芽衣の推理力に驚く。その後、芽衣はゲストだった猪越らの代わりにイベントに参加することに。芽衣は質問があると言って、1年前にある大学で起きた殺人事件の謎を小五郎に尋ねると、芽衣の話を聞いた英理は顔色が変わる。

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小五郎の講演会で、俳優の猪越が何者かに殺害された。小五郎は元支配人の冷泉が犯人と推理する。だが冷泉は、全く別のオーナーの順子を殺害した事件の自供をする。コナンと灰原は、猪越と順子の殺害現場を調べ、2枚の紙片を発見する。二人はその紙片が何かのメッセージと確信する。

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コナンらは、大ホールで行われる小五郎の講演に付き添う。講演２０分前、小五郎が楽屋で寝ていると、突然悲鳴が聞こえてくる。コナンらが悲鳴の聞こえた方に駆け付けると、イベントに出演する予定だった俳優の猪越が遺体で発見される。コナンは現場の状況から密室殺人と判断する。

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コナンらはグランピングにやって来る。その夜、広場で会社社長の戸崎が遺体で発見されるが、遺体には不可解な点が多かった。それは容疑者に挙がった響子、美香、田辺が、それぞれ犯人と疑われるのを恐れてしたことだと判明する。だが、コナンは3人の誰かがうそをついていると確信する。

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コナンら少年探偵団は、公園で朋子という女性と出会う。夫を亡くしたばかりの朋子は、コナンらと行った植物園で梶木という男性と親しくなる。後日、コナンらは朋子の自宅に招待される。コナンらが3階建ての屋上に案内されると、そこで酒に酔った梶木が転落する瞬間を目撃してしまう。

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コナンらが招待されたアンナの誕生パーティーで事件が発生。アンナが覆面の男に射殺されてしまう。続いて、容疑者として捜査中の豹藤が翌日遺体となって見つかったため、高木刑事は事件の真犯人がいると考える。だが、コナンはアンナを殺害したのは豹藤だと確信し、豹藤を殺害した犯人を推理する。

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コナンらはドッグフード会社の女性社長・アンナの誕生パーティーでヨットハーバーにやって来る。だが、直後にアンナは覆面の男に撃たれて絶命し犯人は逃走する。現場に到着した目暮警部が来客に事情聴取していると、アンナの元恋人の豹藤が容疑者として浮上する。だが、豹藤にはアリバイがあった。

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門脇栄二が殺害される事件が起きた後、門脇の家で火災が発生。兄の優一は逃げ出せたが、母親の安子は遺体で発見される。コナンらは、教師だった安子のかつての教え子・高瀬の犯行を疑う。だが、高瀬には当時居酒屋にいたというアリバイがあった。コナンらは居酒屋へ確認を取りに行く。

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公園で青年の撲殺遺体が発見される。目暮（めぐれ）警部らが捜査をしているところにコナンらが偶然通り掛かり、捜査に加わることに。殺されたのは門脇栄二という問題児で、いつも母親の安子に暴力を振るい兄の優一が止めに入っていたとうわさされていた。それを聞いた目暮警部は優一を疑い、事情聴取をする。

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とある村の「村営昆虫人間牧場」を訪れたコナンらは、カブトムシに仮装した小学生から、村の森に国立カジノ付きのスーパー銭湯を造る計画があった話を聞く。だが、森の偵察に来た政府の役人たちが“蛾蛾姫”のたたりに遭い計画が中止になったという。コナンらはこの事件を調べることに。

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黒ウサギ亭で何者かが有里（ゆり）の酒にヒ素を入れる事件が発生。コナンは、蘭が拾った有里の付け爪について、有里の同僚から話を聞くことに。すると、ユリの花が描かれた付け爪は有里のトレードマークだったという。その後、コナンと安室は小五郎の何げない一言によって、事件解決の糸口を見つける。

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