名探偵コナン

小五郎は3人の人物から別々に同じ内容の依頼を受ける。それは競走馬のホワイトスピリッツを守ってくれという内容だった。コナンは、この依頼には何か裏があると考える。その後、小五郎がホワイトスピリッツの馬主の徳吉に会いに行き事情を説明すると、徳吉もまた同じ事を小五郎に依頼する。

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小五郎はコナン、蘭と福岡の小倉を訪れる。小五郎の先輩である深町は、転倒事故を起こして意識不明だった。小五郎は、深町が経営する会社の専務・桐山の依頼を受けて、会社に落書きした犯人を調べ始める。そんな中、門司港レトロにいた蘭は、落書き犯と疑われている深町の息子・虎彦と偶然出会う。

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日本探偵連盟のベスト探偵アワードに選ばれた小五郎は、授賞式に出席するため、コナン、蘭と福岡の小倉へ。小五郎がコナンを連れて警視庁時代の先輩・深町虎三が経営する小倉の会社を訪ねると、専務の桐山栄作から、深町が1週間前に転倒事故を起こしたことを聞かされる。腰のリハビリのために散歩していた深町は、駐車場の車止めにつまづいて転び、頭を強打。今も入院中で、意識不明の状態だという。その後、桐山が小五郎を訪ねてきて、会社の壁に落書きをした犯人を捕まえてほしいと依頼する。

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社会評論家の多津子、女子大講師の立花、OLの美千代から恨まれている可能性のあるダンサーの紗希が、３人の住むマンションから転落して絶命する。コナンは、この転落死は自殺ではなく他殺だと確信。紗希が何かを目撃したことで、３人の誰かをゆすり、口封じに殺害されたと推理する。コナンから3人の存在を聞いた高木刑事は、アリバイがある多津子以外の二人から話を聞き、その結果、大きな秘密を紗希に知られた美千代が紗希を殺害したのではないかと疑う。しかし、コナンは何かが引っ掛かっていた。

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歩美が道端で転び、通り掛かった緑川紗希のアパートで手当てを受ける。その後、歩美はコナンらと紗希のアパートへ。コナンらが紗希と別れ、見回りをしていると、事故が発生。事故現場の野次馬の中で、堂島多津子、立花淳之介、今野美千代が紗希をいまいましそうに見ていることに気付く。

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灰原から解毒薬をもらったコナンは一時的に新一の姿に戻り、蘭、園子、世良らと京都に修学旅行へ。しかし、映画「紅の修羅天狗」の関係者が次々に殺害される怪事件に巻き込まれる。世良は、井隼が殺害された時の状況から、景子、阿賀田、馬山の誰でも殺害することは可能だったと考える。

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灰原から解毒剤をもらったコナンは一時的に工藤新一の姿に戻り、蘭らと共に京都に修学旅行へ。新一は清水寺で母・有希子の友人である女優の鞍知景子と出会う。景子から「暗号を解読してほしい」と依頼された新一が景子の部屋を訪ねると、そこには映画「紅の修羅天狗」の関係者たちが集まっていた。

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灰原が落としたストラップを息子の物と勘違いして拾った男性は潮干狩りに向かった可能性が高く、コナンらは立ち直れない灰原の代わりに海水浴場まで親子を捜しに行く。

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ビッグ大阪VSスピリッツ東京の試合を観戦後、コナンらは阿笠博士の自宅へ。この時、灰原は購入したばかりの比護選手のぬいぐるみストラップがなくなっている事に気付く。

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ミカン狩りに出掛けたコナンは、農園売却の件でもめるミカン園経営者の寺内哲二と息子を見掛ける。

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光彦、元太、歩美、灰原は建設工事現場で遺体を発見する。鉄パイプのようなもので殴られたようだが、現場に凶器は残っていなかった。この後、目暮警部らが捜査を開始し、遺体はゆすりの常習犯だと判明する。その頃、小五郎と温泉に来ていたコナンに光彦から事件についての連絡が入る。

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コナン、光彦、元太、歩美、灰原はコンテナ埠頭で行われている仮面ヤイバーの撮影を見学する。そんな中、コナンと灰原は見学者の中にいる辰巳雅也に目を留める。コナンは不審な動きをする辰巳を怪しいと直感。コンテナ埠頭を離れたコナンらは公園で“ニセ1万円札”とスマホを発見する。

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小五郎、コナン、蘭が乗るレンタカーが山道でガス欠になり、大学生の佐伯遼平が運転するワゴン車で近くのスーパーまでけん引してもらうことに。コナンと蘭が乗せてもらったワゴン車には佐伯の他にゼミ仲間の井上春香、駒田孝弘が同乗し、教授の後藤正司は後部座席で酔っぱらって眠っていた。

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蘭、園子、世良がカフェで京都旅行を計画していると、更衣室でウエーターの更家が大きな花瓶で撲殺される事件が発生。客の本巣、ウエートレスの伊鈴、店長の珠央には殺害する動機があったが、水が入った40kg以上もある花瓶を振り回し、南京錠を破壊するほどの怪力の持ち主はいなかった。

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コナンと小五郎は最近、妙にウキウキしている蘭を尾行する。蘭は京都のガイドブックを購入後、カフェを訪れる。様子をうかがっていると、蘭と合流したのは園子と世良だった。蘭は女子だけで旅行を計画していた。コナンは蘭が新一にそっくりな沖田総司と会いたがっていると知って動揺する。

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コナンらとデパートに来た元太が二人組に連れ去られる。二人組はワンボックスカーに乗って逃走。コナンらは交通課の由美と苗子を見つけ、ミニパトで追跡してほしいと頼む。その後、コナンは元太が持っている“DBバッジ”を通して、車内の二人組の会話から元太が連れ去られた理由を知る。

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平次が出場する全国高等学校剣道大会の昼食休憩中に審判員の抜谷が喉元を切られて殺害される。そこで、容疑者として浮上した現場近くのトイレにいた法村稔司ら3人の持ち物を調べるが、凶器のカッターナイフは見つからない。しかし、平次は何を使って殺害したか、誰が犯人かを見破る。

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全国高等学校剣道大会が開催され、コナンと蘭らが応援する中、平次は準決勝まで勝ち進む。準決勝までの空き時間、コナンと蘭はトイレを探していた。その頃、体育館の北口のトイレの前で胃腸薬を飲もうとしていた審判員の抜谷士道が、剣道着姿の何者かに喉元を刃物で切られてしまう。

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コナンと蘭は、星の観測をしたいという園子に付き合い公園に来ていた。園子が双眼鏡を町に向けると、ある花壇の陰から何者かが遺体の腕らしきものを持ち上げているのを目撃する。その花壇は佐々木スタジオの前にあり、園子が所長の博人に事情を説明するも、マネキンの腕だと一蹴されてしまう。

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覆面姿の2人組が米花町の宝石店から宝石を奪う事件が発生。強盗犯の鷹取はコナンを人質に取って逃走する。鷹取を裏切った共犯の内海は廃工場で絶命していた。鷹取はコナンが邪魔になると、走っている車からコナンを蹴り落とす。コナンは黒幕に報復しようとしている鷹取の行方を追う。

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