GO！GO！アトム

ラボのそばのビーチで楽しい時間を過ごしているアトムたち。と、突如ミッション発生！　アルプスで起きた雪崩で鹿たちが動けなくなってしまったのだ。そしてOT2のスクリーンに映し出された現場には見慣れた姿も…スキーに来ていたブラント博士とセレナ博士だ！　早速アルプスへ出発！　博士たちを無事に救出したアトムたちだったが、また新たな雪崩の危険が迫ってきていた。ゲレンデにはスキー客もいる…。果たしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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ミッション発生！　大都市で起きた大停電で、たくさんの人が困った状況に陥っている。そしてその中には反物質で実験中のフュージョン博士も！　反物質はとっても危険で、常に冷やさなければ爆発してしまう。今は非常用電源で冷却装置を動かしているけれど、もし電気が戻るまで非常用電源がもたなければ…大爆発が起きて都市が地図から消滅してしまう！　急げアトム！みんなを救え！　果たしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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南米のとある村でトラブルが発生！　シロアリの群れが作物を食い荒らしているようだ。普段は作物を刈り取った後に残る刈草を食べるはずなのにどうしたんだろう。現地に到着したアトムたちが見たのは、農家の人によって刈草が焼かれるところだった。だからシロアリが健康な作物を食べざるを得なかったわけだ。作物を食べないようにシロアリの女王に交渉する作戦を思いついたアトニャンだったが…。果たしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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シロサイがアフリカの村で大暴れ！　穀物を荒らして村人の小屋を破壊している。村に到着したアトムたちは大暴れの理由を探そうにもシロサイが強すぎて近づけない。と、アトムがシロサイの角の横に木のとげがささっているのを発見！　このとげが痛くて暴れていたのだ。さあ、シロサイをどうにか落ち着かせなくちゃ！　でもどうやって？　このままじゃ暴れるシロサイに近づけない。果たしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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お互いの態度に腹が立っているアトニャンとスズはもっかけんかの真っ最中。とそこにミッション発生、ブラント博士の妹で有名な生物遺伝学者のアミーからのSOSだ。アミーは今、熱帯の島にいるらしい。そして背後で何か巨大なものがガサガサと音を立てている。さあ、ミッションだ！　なのにアトニャンとスズはまだけんか中、お互いそっぽを向いて、悪口を言い合ってる状態だ。どうするアトム、果たしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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ネズミに占拠されてしまったショッピングモール。お客さんもびっくりしてモールから逃げちゃった！　アトム達が到着すると、大型のネズミがいろんなところで大騒ぎ。通路もレジも食品棚もネズミ、ネズミ、ネズミだらけ！　アトムたちはネズミを追い払おうとするけどうまくいかない。いったい原因は何？　スズのタブレット情報によれば、ネズミの嗅覚は動物の中でも最も鋭いみたいだけど…はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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OT2に映ったのは野生動物保護官のアリソンだ。大地震の前兆の揺れを受けて、動物達を森の外に避難させなければならない。もっと大きな地震がやってきたら、アメリカ杉の巨木が倒れて動物達が死んでしまう。その被害はとっても大きい…。そこで動物達の避難を手助けにやってきたアトム達、だがそこに突如、不吉な地響きの音が…。はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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宇宙からのSOSだ！　通信衛星に宇宙ゴミが衝突した影響で大規模の通信障害がおきている。壊れたアンテナを修理し、さらなるトラブル回避のため宇宙ゴミを片付けに出発したアトム達。軌道上に到着してみると、宇宙ゴミがいたるところに散乱している。ゴミ同士をくっ付けて回収しようとするが、無重力の宇宙では思ったように作業ははかどらず…はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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今日のラボはのんびりムード。スズはプリズムの原理をアトムに講義中、お茶の水博士は新しい発明品をアトニャンに装着中、ブラント博士はセレナ博士を無理やり捕まえて社交ダンスのレッスン中。と、そこにミッション発生！　トンネル工事をしていた作業員達が地下に閉じ込められてしまった！　そして今にもトンネルは崩壊しそう！　はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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ミッション発生！　OT2が映し出したのは、交通量の多い道路を妨げるように歩くゾウの姿です。ゾウは仲間たちと一緒に移動するのですが、そのルート上に人間が新たな道路を作ってしまったのです。ルートを変えることのできないゾウたち…。そこでアトムたちは道路の下にトンネルを作ります。これで問題解決かと思ったのですが、農場では別のやっかいな問題が発生します。はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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ヒョウタンツギたちが風邪を引いたような症状になっている頃、ミッションを知らせる警報が３回も間違えて作動していました。どうやらヒョウタンツギの調子が悪いことと関係しているみたい…。そんな中、アトニャンがヒョウタンツギを追いかけまわすと、ヒョウタンツギの世界につながるミッションゲートがオープンして、アトニャンが吸い込まれてしまいました！　誰も行ったことのない未知の世界に…。はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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広い草原に巨大な竜巻が発生。大木から枝がもぎ取られ、渦の中にのみ込まれていきます。チームアトムは竜巻被害の拡大を止められるようミッションに挑みます。協力しあい草原の動物たちを安全な場所に避難させます。なんとか竜巻の近くにいたシカたちを避難させることができましたが、まだ子ジカが取り残されていた！　助けに向かったアトムとアトニャンは竜巻にのまれてしまい、さらに竜巻はどんどん街の方に…。はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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アトニャンが大好きなアニメキャラのガラクタン。宇宙で起きるどんな事件もむしゃむしゃ食べて解決するゴミ箱ロボットです。このロボットのテーマパーク・ガラクタンランドに遊びに来たチームアトムとお茶の水博士たち。パークにいるガラクタン型のゴミ収集ロボにアトニャンがいたずらをすると、ガラクタンが暴走し始めちゃった！　パーク内の物を何でも食べだし、ついにはお茶の水博士も…。はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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科学者のユーリとエレナがシベリアで、地球温暖化が永久凍土に与える影響を調査していると、突然地面が爆発しエレナが地下の空洞に閉じ込められてしまいました！　どうやら有毒で燃えやすく直ぐに爆発するメタンガスが原因のようです。地下は空気も少なく、メタンガスもたまっているかもしれない。今回のエレナの救出は、細心の注意が必要な緊急ミッションです！　はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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希少動物保護園のマウンテンゴリラのボボが、人間の女の子ミリーをさらって脱走しました！　ボボを傷つけず無事にミリーを助けなければ！　現場に到着したチームアトムはあの手この手で救出を試みますが、ボボは言うことをきいてくれません。しかも驚いたことにミリーはボボと楽しそうに遊んでいます。アトムたちは説得しようと四苦八苦。そんな中、スズは意外な解決策を思いつきます。はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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地質学者のマテオが地下の洞窟に閉じ込められてしまった！　地下の水を調べている途中で岩が崩れてきたみたい。救出に向かったアトムたちは溺れかかったマテオを間一髪で助けます。マテオによると洞窟の水が酸性になったせいで、酸性に弱い石灰岩でできた地下を削り続けているようです。良く調べると近くのビルの地下も石灰岩でできていて、ビルの地面が陥没するかもしれない！　はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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コウノトリのお母さんがヒナにあげるエサがなくて困っています。かつては魚がたくさんいた湖がなぜか今、全然いなくなってしまったからです…。緑のウキクサでぎっしりと覆われてしまった湖、これでは魚に必要な光や空気が遮られてしまいます。でもどうしてこんなことになってしまったのか？その原因を突き止めようとアトムたちは湖の中の調査を開始します。はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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新しい研究のためブラント博士が向かった先は太平洋のマリアナ海溝。そこでは最近2隻のボートが沈没していて、原因が分かっていません。もしかすると、博士が探している海の巨大な生物の仕業では…？　急がないと博士があぶない！　チームアトムは博士を助けるために現場へ向かいましたが、博士は喜ぶどころか研究の邪魔するなとご機嫌斜め。そんな中、巨大生物が住んでいると考えられる深海へと向かうとそこには…。はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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最近、ある農場の周辺で砂嵐が頻繁に発生。そんな場所じゃなかったはずなのに…。原因の解明と農場の人たちを助けるため、チームアトムが現場に向かい調査すると、ヤシノ木の森が牧草を育てるために伐採され、草も木も生えていない土地になっていました！　この伐採が原因で土が乾燥し、作物も育たなくなり、砂嵐が起きてしまっていたようです。そんなとき、接近する砂嵐をスズがキャッチ。すごい勢いで農場に迫っています!!　はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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ライオンたちの様子がおかしい!?　アフリカのサバンナで、獣医のダカライと娘のアクアが凶暴になったライオンから避難し身動きがとれなくなっています。助けにいったチームアトムはなぜライオンたちがおかしくなったのか原因をつきとめることに。ライオンと同じネコ科のアトニャンははりきって自ら追跡することをかってでますが…。やがてその原因は、干ばつによるストレスだと分かります。そこでスズが近くに川を発見しますが、その水は汚染されていることがわかり…。はたしてチームアトムはミッションコンプリートできるかな？

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