忍者に結婚は難しい

殺害された赤巻議員（信太昌之）の家を調べる蛍（菜々緒）と悟郎（鈴木伸之）。そこに雀（山本舞香）から、蛍らの母親を殺した斉藤という男の正体が風富城水（市村正親）だという連絡が入り、悟郎はショックを受ける。そして、赤巻邸を出た蛍と悟郎は小夜（吉谷彩子）に襲われ、悟郎は意識を失ってしまう。

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蛍（菜々緒）は小夜（吉谷彩子）から、伊賀から悟郎（鈴木伸之）を解放する条件として、議員の豊松（村上新悟）を殺害する任務を言い渡される。任務を受けることにした蛍は、豊松の元へ。一方、捕らわれている悟郎の前に突然、宇良（藤原大祐）が現れる。宇良は蛍の任務内容を悟郎に伝え、二人は蛍の元に向かうため逃げる。

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議員を殺した真犯人の情報をつかむため、伊賀本部に向かった悟郎（鈴木伸之）だったが、何者かに襲われてしまう。目を覚ました悟郎は目の前に現れた音無（勝地涼）に二人で話しがしたいと頼む。一方、蛍は悟郎がいるビルの近くで伊賀忍者の襲撃に遭う。絶体絶命になった蛍の前に白い煙が立ち込め、ある人物が現れる。

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仲直りをした蛍（菜々緒）と悟郎（鈴木伸之）だったが、蛍の携帯に危険を知らせる連絡が来る。蛍は家から逃げようとするも、悟郎の行動や蛍の素性を怪しむ小夜（吉谷彩子）と音無（勝地涼）が家を訪ねてくる。仕方なく悟郎が二人を家に上げて話を聞く一方、蛍は隠れて悟郎と小夜ら3人の様子をうかがう。

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互いの正体を知り決着をつけようとバトルをする蛍（菜々緒）と悟郎（鈴木伸之）だが、本当の気持ちに気付き戦いをやめる。そして、今までの行動について話し合い、二人は赤巻（信太昌之）を殺した真犯人を一緒に捜すことに。そんな中、SNSに中傷コメントを発見した雀（山本舞香）は、何者かに尾行されて恐怖する。

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蛍（菜々緒）が甲賀忍者だと確信を持った悟郎（鈴木伸之）は決着をつけようと、覚悟を決めて帰宅する。一方、蛍もさまざまな証拠から悟郎が伊賀忍者だと気付く。蛍と悟郎は互いに複雑な心境を抱えながら食事をし、何事もなく就寝することに。翌朝、悟郎は蛍の不意をついて攻撃するが、蛍は悟郎の攻撃をかわす。

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事件があった赤巻邸近くの防犯カメラの映像を確認した悟郎（鈴木伸之）は、そこに写る女性の動作を見て、蛍（菜々緒）が甲賀の忍者ではないかと疑い始める。そんな悟郎を小夜（吉谷彩子）は気にかける。一方、蛍の携帯に雀（山本舞香）から、楓（ともさかりえ）が意識不明で倒れたと連絡が入る。蛍は急いで病院に向かう。

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チャリティーイベントで起きた爆弾テロ事件をきっかけに、蛍（菜々緒）と悟郎（鈴木伸之）は互いに爆弾テロに関わりがあるのではと疑っていた。そして、蛍と悟郎はさりげなく聞き出そうとするも、どうにかごまかし合う。そんな中、本部からの呼び出しを無視した音無（勝地涼）は、甲賀の内通者ではないかと疑われる。

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悟郎（鈴木伸之）ら伊賀忍者はチャリティーイベントで爆弾テロが起こるという偽情報を甲賀忍者に流し、おびき出す作戦を企てる。一方、爆弾テロの情報を聞いた蛍（菜々緒）はチャリティーイベントにどう出席するか悩んでいた。そんな中、ボランティアでの参加が決まっている悟郎は、蛍に「手伝ってもらえないか」と頼む。

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擦れ違いばかりの夫婦生活に疲れた蛍（菜々緒）は、離婚届を置いて家を出る。そして、竜兵（古田新太）のアパートに身を寄せることにした蛍は、妹の雀（山本舞香）に赤巻邸での出来事を打ち明ける。一方、悟郎（鈴木伸之）は赤巻が毒殺され、現場から逃走した不審者が甲賀者の疑いがあるとの報告を受ける。

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敵対するライバル忍者の末裔同士が互いの正体を知らずに結婚し、生活していく姿を描いたラブコメディー。結婚して2年半の蛍（菜々緒）と悟郎（鈴木伸之）は結婚当初はラブラブだったものの、感情の擦れ違いやかみ合わない会話から徐々に夫婦関係が冷えて破綻寸前に。そんな中、それぞれに“特殊任務”の指令が舞い込む。

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