EDENS ZERO 第2期のあらすじ
【最終回】シキたちが、グッドウィン率いる反乱軍オアシスを訪れ共闘を申し入れていると、突然帝国軍の襲撃を受ける。大規模な戦闘に突入し、シキたちとオアシスは共に応戦するが、帝国軍にはフォレスタで相対したオークも帯同しており、機械を抹殺するためのとんでもない作戦を決行しようとしていた。
ネロの息子、ポセイドン・シュラは葵宇宙の民の前で「全ての機械を抹消するジャッジメント・デイを開始する!」と高らかに宣言。そのことを知ったシキたちはシュラを止めることを決断する。シキの本気の意思を確認したラグナは、「砂の惑星サンドラに手を貸してくれそうなやつがいる」と告げる。そこで、サンドラに入ったシキたちは、ポセイドン・ネロに立ち向かう組織のもとを訪れる。
シキたちは、ゼノリスによる拘束下でのエーテル低下克服VR訓練、“緊縛訓練”を受ける。だが、訓練中に突然ジギーが姿を現し、レベッカを重力で痛めつける。それを見たシキは、怒り、拘束をといてジギーに襲い掛かる。だが、それはゼノリスがわざと見せた映像だった。その後、シキたちは、どんどん厳しさを増すゼノリスの修行に音を上げてしまう。
ワイズとハーミットはミュラー博士を倒す。フォレスタを脱出し、エデンズゼロに戻ってきたシキたちはエルシーと通信し、互いの無事を確認する。一方、ウィッチは親友を失ったフォレスタの少女・アルナに優しい言葉を掛け抱きしめる。また、クリーネはシスターの治療によって笑顔を取り戻し、ジンはその笑顔を見て涙する。
過去に決着を付けるため、エルシーとジャスティスは死闘を繰り広げる。互いのエーテルがぶつかり合うその瞬間、シキの前に現れた魔械流柔術創始者ゼノリスの“重心”が発動する。エルシーとジャスティスも影響を受け、互いに重傷を負うも決着はつかず戦いは中断することに。そんな中、自らをジギーの師匠と語るゼノリスにシキは驚く。