京都市内のビジネスホテルで客や従業員、計30人以上が嘔吐、苦悶し次々と倒れる事態が発生。マリコたち科捜研メンバーも応援要請を受けて臨場する。ホテルから一番近い位置にある交番で巡査を務める新開颯太(鈴木福)に防犯カメラの場所を案内してもらう中、彼が硫化水素中毒を疑ったと話すのを聞いて疑問に思ったマリコ。そこに土門薫(内藤剛志)ら捜査一課が駆けつけ、毒物を使った無差別大量殺人ではないかと捜査を始める。
新たに京都市役所からの人事交流で派遣されてきた会計係・加瀬淳平(加藤)を加え、事件についての会議をする科捜研メンバー。亡くなったホテルスタッフの男性の組織検査をした結果、彼が「横紋筋融解症」で死亡したことが判明。さらに、胃の内容物・吐しゃ物を鑑定すると、「イソトキシン様毒」が微量に検出される。
次回、第2話は7月10日(水)に放送。食品加工会社社員・門脇卓(真丸)の遺体が公園の石段の下で見つかり、科捜研メンバーは臨場。所持していたはずのスマートフォンが見当たらなかったことから、事件性を疑った捜査一課刑事・土門薫(内藤剛志)たちは捜査を開始する。
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