名探偵コナン

コナンは、東京にやって来た平次、和葉と共に世界最大級のコンクパール「妖精の唇（フェアリーリップ）」が展示されている博物館“鈴木ミュージアム”にやって来る。怪盗キッドがこの宝石を狙っているらしい。鈴木次郎吉のキッドへの挑戦状には「その宝石は全方向から速やかに見ていただける準備をしています」と書かれており…。

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コナンたち少年探偵団がケガをした猫を保護した日、夏目漱石の小説「坊ちゃん」を再現した料亭「坊っちゃん亭」で接客係主任の“うらなり”が遺体となって発見された。警察の捜査が進む中、犯人の有力候補と思われた経営者の“赤シャツ”までもが、翌日、遺体となって発見される。警察は逃げられないと考えた末の自殺だと考えるが…。

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コナンら少年探偵団は、公園で何者かに暴行された猫を見つける。猫を病院に運んだコナンらは、猫の爪に残る血痕と繊維から犯人捜しを開始。一方、「坊っちゃん亭」という料亭では、接客係主任が遺体となって発見される。遺体の上着は猫の爪に残った繊維と似た物が使われていた。

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小五郎の元に高木刑事たちがやって来て、最近頻発している“おかしな事件”について話し始める。それらの事件の証拠品には必ず”事件のプロット”があったのだ。そこから犯罪アドバイザーの居所を突き止めた刑事たちは、小五郎に警察側のアドバイザーとして協力を依頼してきて…。

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小五郎の元に「大切なブローチを盗まれた」という女性・香苗がやって来る。犯人に指定された公園に向かう小五郎と香苗だったが、そこでも場所の移動を指示される。移動中も危険を感じ、小五郎は香苗が命を狙われている可能性を考えるが…。

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公園にバードウォッチングにやって来たコナンたち少年探偵団。推理力向上のために双眼鏡で人間観察を始めると、川の対岸で変装した高木刑事たちが張り込みをしており…。

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投資会社の社長にボディーガードを依頼された小五郎は、コナンと共に様子を見に行くが投資の内容は詐欺まがい。断って帰ろうとしたところ社長の遺体が発見され、さらに…。

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コナンと小五郎は、行方不明のペットを捜す依頼を引き受ける。捜査中にコナンらがタクシーに乗ると、運転手は「小五郎のファン」と言い、先ほど乗車した不審な“サングラス兄弟”について語る。コナンは運転手の話から、兄弟が祭りの売上金を狙っているのではないかと推理する。

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コナンと蘭は、駅前で失踪した妻を捜す男性と出会う。失踪した日は、お祝いをする予定で、財布や携帯電話も自宅に置いたまま。事件だと考えたコナンと小五郎は、自宅近くで聞き込みを開始する。ところが、出てきた話は男性と妻がもめていたというような話ばかりで…。

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コナンの推理によって、警視庁交通部の橙子と紫織を殺害した犯人が判明する。その頃苗子は、由美の連絡先を聞き出そうとする犯人に監禁されていた。苗子は決死の覚悟で千葉刑事に連絡を入れるが話すことができず、監禁場所のヒントを残すだけで犯人に携帯電話を取り上げられてしまう。

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警視庁交通部の橙子、紫織が立て続けに殺害された。佐藤刑事らは現場付近の聞き込みで、1週間前に別の事件があったことを知る。そこへ交通課の由美が現れ、「駐車禁止の標識」がダイイングメッセージではないかと助言する。一方、現場でコナンは千葉刑事から捜査状況を聞き出し、ある事に気付く。

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警視庁交通部の橙子（とうこ）が遺体で発見される。事件は1週間前、橙子と紫織が交通違反の取り締まりで口論になった3人の男性の関与が疑われる。そんな中、今度は紫織が襲われる。一方コナンは、1週間前に交通違反の取り締まりが行われた現場近くにある、喫茶ポアロで安室に聞き込みをしていた。

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コナンらは通学の途中で交通課の三池苗子と出くわす。苗子はコナンらに交通ルールを教えながら一緒に学校へ向かう。その後、苗子はなかなか進展しない千葉刑事との恋愛に悩み、憂さ晴らしに同僚の紫織、橙子とカラオケに行く。帰り道、一人になった橙子は、不審な男に声を掛けられる。

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コナンらは旅行先の金沢で誘拐事件に巻き込まれる。だが、それは被害者である元友禅作家・学の自作自演だったことが判明。しかし、学の雇い主の林が襲われるという新たな事件が起きる。さらにマリの元には、容疑者の学からマリの弟子である凛太朗を誘拐したと脅迫電話がかかってくる。

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コナンは蘭、小五郎と金沢旅行にやって来る。3人が金沢を満喫していると、不審な行動を取る女性・マリと出会う。マリは何者かに誘拐事件の身代金受け渡しを指示されていた。その後、人質は解放されたが、コナンは犯人がマリの行動範囲を知っていたことから、知人の可能性があると考える。

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恩田、末村を爆殺した犯人は亡くなった米倉だった。動機は10年前の4人組による強盗事件。米倉は恩田からゆすられ、かつての仲間全員の殺害を計画。だが、さらに5人目の強盗犯がいた事が判明し、コナンと平次は米倉がもう一人も殺害するため、どこかに爆弾を仕掛けていると確信する。

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爆弾を使って3人の命を狙った容疑者として、かつて被害者たちと自主映画上映会に参加していた石澤が浮上する。大滝警部らは石澤の自宅へ踏み込むが、そこで監禁された石澤を発見。自宅から爆弾は見つからず、コナンは石澤の自宅を調べ、平次は京都で殺害された恩田について調査する。

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コナンと平次が犯人と見破った高内と三原は、米倉の車で逃走するが、直後に車が爆発。運転していた高内は即死する。一方、京都府警の綾小路警部は、脚本家の恩田が車で転落死した事故を捜査。綾小路は恩田と米倉の接点を突き止めるが、さらに爆発事件が起きて新たな犠牲者が出てしまう。

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4週にわたり、アニメオリジナルエピソードを放送。コナンらは映画の制作発表会に招待され、大阪にやって来る。制作発表中、プロデューサーの米倉が倉庫で怪獣フィギュアの下敷きになり、絶命する事故が発生。だが、フィギュアを支えるロープが切られており、大滝警部は事件と判断する。

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コナンは、小五郎の講演会で起きた2つの殺人事件を解決に導いた、芽衣の推理力に驚く。その後、芽衣はゲストだった猪越らの代わりにイベントに参加することに。芽衣は質問があると言って、1年前にある大学で起きた殺人事件の謎を小五郎に尋ねると、芽衣の話を聞いた英理は顔色が変わる。

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