名探偵コナン

小五郎が人気アイドル歌手・リサのボディーガードを依頼され、リサのライブに招待されたコナンと蘭もライブの開始を待つ。開始直後、会場に非常ベルが鳴り響き真っ暗になると、仮面をかぶった二人組がリサを誘拐しようとする。だが、犯人はリサのコスプレをした蘭を間違えて誘拐し、コナンらは犯人を追い掛ける。

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小五郎は、鳥海コンツェルンの御曹司・鳥海春樹から失踪した婚約者の川口元子を捜索してほしいと依頼される。聞き込みを始めた小五郎とコナンは、3日前の夜に元子が大家に引っ越しする事、上司に仕事を辞めると伝えていた事を突き止める。元子と最後に接触したと思われる寺門しげみに話を聞いた小五郎は、しげみが元子を殺したと推理するが、コナンは順調な展開に違和感を覚える。

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ある夜、宇宙人の着ぐるみを着た会社員の竹寺の姿に驚いた男性が、寺の石段を踏み外して事故死する。翌朝、コナンらが事故の話をしていると、竹寺を知る小学1年生の幸大が、事故は宇宙人を信じる自分のせいで起こったと話に入ってくる。その後、コナンは現場に居合わせた亜里紗らから話を聞き、違和感を抱く。

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女優の杏奈が密室で殺される事件が発生。コナンは、現場の状況から杏奈とブログの人気ランキングを争っていた女優の沙弥が犯人だと考える。沙弥から話を聞いたコナンは、杏奈の部屋に入った方法と凶器に目星を付け、杏奈のブログから沙弥の秘密に気付く。その後、コナンはみんなの会話から密室トリックを見破る。

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ホテルのケーキバイキングを訪れたコナンらは、女優の北見沙弥、庄野杏奈と知り合う。二人は番組の企画でブログの人気ランキングを争っている途中で、杏奈は沙弥にブログで秘密を公表されたくなかったら白旗を揚げるよう要求する。そんな中、杏奈が密室で殺害され、コナンは現場の状況から犯人の目星を付ける。

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朝、喫茶ポアロで安室のことを見ている不審な男性客に気付いたコナンは、下校時間にもポアロでその男性を見掛ける。コナンと一緒に下校していた光彦、元太、歩美は、コナンの様子からその男性が怪しいと考え3人だけで尾行するが、商店街で姿を見失う。一方、コナンは黒ずくめの組織や公安ではないかと警戒する。

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コナンらは、長野県警の竹田、鹿野、秋山が次々と殺害される事件に遭遇し、黒田捜査一課長は大和警部を指名手配する。一方、由衣刑事から半年前の銀行立てこもり事件や鹿野の結婚前の名字について聞いたコナンと諸伏警部は、事件の真相に近づく。そんな中、大和に山小屋へ呼び出された三枝警部に、犯人が迫る。

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長野県警の竹田警部が殺害された事件に続き、鹿野警部補も自宅で首をつった状態で発見される。諸伏警部は状況から何者かが絞殺後、天井からつるしたと考える。その後、犯人からあと3人の殺害を示唆するメールが届く。さらに、犯人に呼び出された秋山巡査部長が車で崖から落下し、コナンは次の標的を推理する。

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コナンは蘭、小五郎と共に観光に訪れた長野・川中島古戦場跡で、聞き込みをしていた長野県警の大和警部らと出会う。大和らと観光地を巡ったコナンらは、千曲川のつり橋から川の中に竹田警部の首が浮かび上がるのを目撃する。その後、竹田に恨みを持つ人物を捜す捜査一課は、竹田が被疑者を射殺した二つの事件に着目。そのうち、９年前に射殺された男性が大和の幼なじみだと分かる。

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妖怪・鎌イタチが現れたと話題の旅館で、鎌イタチの仕業と思われる事件が発生する中、おかみの高美の義父・盆蔵が殺される。コナンは、現場の状況に違和感を覚え、平次は犯人が露天風呂を通って現場に来たと推理。だが、犯人は露天風呂の湯の上を走ることになるため、コナンと平次は事件発生時の聞き込みを始める。

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鎌を背負った人物が露天風呂の湯の上を走る写真を入手した平次は、その正体を調べるためコナンらと共に長野の山奥にある旅館を訪れる。そこには、写真を雑誌に掲載したライターの中間と、真相を暴こうとするライバル誌の小柳も訪れていた。そんな中、平次らが暗闇の蔵の中で体の一部分を切られる事件が発生する。

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腹話術師・天願の妻・和子が自宅で殺害され、現場で発見されたレコーダーなどから和子の浮気相手で天願の弟子・登川の指紋が検出される。さらに、登川のかばんから和子の血痕が付いた眼鏡が出てくるが、登川は犯行を否定。そんな中、再び天願の自宅を調べたコナンは、最初に調べた時の違和感の理由に気付く。

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腹話術師の天願は多重人格に陥り、人形の人格が妻の和子を殺害しないよう監視してほしいと、小五郎に依頼。だが、小五郎が専門外だと断った翌朝、和子が殺害される。天願は人形に命令されて和子を殺害したと自白するが、目暮警部らは和子の浮気相手・登川の犯行だと推理。そんな中、コナンは天願の自宅を調べ、凶器となったトロフィーが置かれていたサイドボードに違和感を抱く。

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児童公園で連続放火事件が発生し、コナンら少年探偵団は夜回りを開始。すると3件目の放火現場に遭遇し、公園から走り去る男性を発見する。続く4件目の現場で再びその男性・釜石を見掛けるが、放火犯を捕まえようとしていたことが判明。コナンらは釜石と共に犯人捜しを始めるが、釜石は途中で姿を消してしまう。

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鳥取で地元の名家・熊堂家から家宝が盗まれる事件に遭遇したコナンは、犯人が金銭を奪わず家宝を返したことに疑問を抱く。そんな中、鳥取県警の山根は小五郎の内部犯説にのっとり、一家のアリバイを徹底的に調べる。その後、元家政婦の直美のアリバイが気になったコナンは、直美の伯父・足立から話を聞くことに。

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コナンと蘭を連れて鳥取を訪れた小五郎は、地元の名家から家宝が盗まれ1000万円を要求される事件に遭遇。現場に落ちていたペンダントから元家政婦の直美に容疑が掛かるが、小五郎らはその時間に美術館で直美を見掛けていた。小五郎は真犯人が他にいると考えるが、コナンは直美の態度から事件との関係性を疑う。

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闇金会社社長・佐伯の娘・礼奈が誘拐され、目暮警部らが駆け付ける。誘拐犯は家政婦の鈴子を指名し、身代金1億円を持ってこいと要求。犯人が身内でもない鈴子を運搬役に選んだことが気になったコナンは、鈴子に発信機を取り付ける。その後鈴子が指定された公園に到着すると、誘拐犯は発信機を警戒して、バッグや車を変えるよう命令。さらに、警察の裏をかくような指示を繰り返す。

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コナンら少年探偵団がサッカーの練習をする予定だった阿笠博士の知人の屋敷跡で、男性の遺体が見つかる。男性は後頭部を強打しており、第一発見者は先に到着した阿笠博士だった。だが、跡地はれんが塀と有刺鉄線に囲まれ、博士の持つ鍵でしか中に入れない。コナンらは実質的な密室で起きた事件の推理を始める。

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コナンは思いがけず、女子大学生の芙奈子と共に行方不明のフリーター・彦根を捜すことに。まずコナンらは、彦根のアパートを訪れ隣人らに会うが、有力な情報は得られない。その後、強盗計画が書かれたノートを彦根が残していたことを確認。コナンがその宝石店を特定すると、実際にその宝石店が強盗に襲われる。

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