デジモンアドベンチャー：のあらすじ一覧
荒野の水源をめぐって激しく争っている2つの荒くれデジモン集団に、丈とゴマモンが別々にさらわれてしまった。救出のためにアグモンと別行動をとった太一は、「水の番人」である老兵のノヘモンと同行することに。かつて平和な水源を守るために戦い、敗れたノヘモン。二つの荒くれ集団がのさばり、水を独占しようと激しく争うせいで、水源の周りは荒れ果ててしまっていた。ノヘモンの事情を聞いた太一は、二つの荒くれデジモン集団を「まとめてぶっ潰してやる！」と宣言する。果たして太一の作戦とは…？
旅を続ける太一たちの前に、突然、セフィロトモンという不気味な姿のデジモンが現れた。セフィロトモンの放つ怪しい光により、その体内に吸い込まれてしまう太一、ヤマト、空、光子郎、そしてタケルの5人。セフィロトモンの内部は不思議な空間になっており、太一たちは分断され、これまでに倒した無数のデジモンたちが襲って来る。倒しても倒しても、次々に復元される敵デジモン。さらにタケルとパタモンは、因縁深いデビモンと相まみえることに！
ファーガを目指す旅の途中、太一たちは廃棄された古いサーキットに行き着いた。だが、そこにはマッハモンという往年のチャンピオン・レーサーがいて、今でも一人孤独にコースを走り続けている。走りを愛するガルルモンは、ヤマトを乗せマッハモンに勝負を挑む。無限大陸に来て以来うわさに聞いていた、レジェンドにスピード勝負を挑んだのだ。だがマッハモンは、走行中にガルルモンに危険な攻撃を仕掛けてくる。それは、かつて人気のあった「デスレース」のルールで、走行中の攻撃は全てOKという物騒なもの。しかし、「かつてのマッハモンはクリーンなレーサーだった」といううわさを聞いていたガルルモンは、純粋なスピードレースをしようと言い出し、そして…。
謎のDIMカードに記録されていたデータから、ファーガへの道を解析した太一たち。草木の生えない荒野を走る中、気付けば背中に巨大な森を持つデジモン・ペダルドラモンの背中に乗り上げていた。「森の守護者」と呼ばれるペダルドラモン。森を枯らす敵との戦闘に全身が傷付きながらも、自身の使命を全うすべく進んでゆく。そんなペダルドラモンに寄り添ったのはヒカリだった。無理を押して戦おうとするペタルドラモンの誇りを尊重し、手助けをしたいと願うヒカリとテイルモン。果たして森を守ることができるのか。
太一たちが訪れた森に突如響き渡る大音量の歌声──。声の主はエレキギターをかき鳴らしながら歌うエテモンである。そこではともに自分こそが最強であるとして譲らないエテモンとボルケーモンが、キング・オブ・デジモンの座を巡り争い続けているのだった。なぜか太一たちを倒した者がキングオブデジモンであるということになり、襲いかかってくるエテモンとボルケーモン。音響攻撃によってアグモンたちが奇妙な行動を起こし無力化される中、ミミとパルモンがリズムに乗ってエテモンたちに立ち向かう──！
コモンドモンを降り付近の探索に出掛けた太一、アグモン、光子郎、テントモンは、目の前に広がる広大なゴミ捨て場を見て驚く。さらに、そこで出会ったガーベモンとチューモン、レアモンの存在にも驚かされる。レアモンはなんでも食らう怪物で、黒いエネルギーの研究を続ける科学者のガーベモンは、レアモンによって多くのチューモンたち（部下）を失い、復讐（ふくしゅう）に燃え、対レアモン用の特殊バズーカを開発している。だが、いざレアモンとの戦いに突入するとバズーカは役に立たず、レアモンはその場に満ちる黒いエネルギーを吸収、完全体のレアレアモンに進化して襲い掛かって来る。絶対絶命のその時、光子郎はある作戦を思い付く…。
食料を探しに出掛けたヤマトとタケルの兄弟は、深い霧の中、デジモンだけの遊園地“もんモンパーク”へと迷い込んだ。お客さんが来なくて寂しがっている案内役のオポッサモンのために、ヤマトとタケルは少しだけ遊んで行くことにする。だが、それはオポッサモンの仕組んだ恐ろしい罠だった。ヤマトとタケルは離れ離れになり、それぞれ待ち受けていた敵と戦うことになる。果たして二人は、無事にもんモンパークから脱出することが出来るのか!?
ある日子供たちの前に突然現われた空飛ぶジャングルと、そこから落ちてきた果物。太一・アグモンと空・ピヨモンは、みんなの分の果物を取るべく空飛ぶジャングルに向った。だがそこでは先住デジモンのポームモンたちが、侵略者トロピアモンとその部下ラプタードラモンたちによって果物の形状にされてしまい、やがて食べられてしまう運命にあった。怒った空と太一は、ポームモンたちを救出し空飛ぶジャングルをポームモンたちの手に取り戻すためにトロピアモンに立ち向かうが、なんと太一とメタルグレイモンが果物にされてしまう！ 空は太一たちの救出に、ガルダモンはトロピアモンとのバトルに挑むが、果たして太一らやポームモンたちを助け、ジャングルを取り戻す事ができるのか…。
太一たちが立ち寄ったオアシスは、バーガモンがおいしいバーガーやポテトを振る舞うサービスエリアのような場所。コモンドモンは洗車してもらっていい気持ち。丈はポテト好きのデジモン「ポテモン」とフライドポテトを通じて意気投合、ポテト愛を熱く語るのだった。ところが捨てられてしまうポテトに怒ったポテモンがジャガモンへと進化、サービスエリアを襲撃！ 果たして丈はポテト愛でジャガモンの心を救えるか？
怪しげな呪文を操り、か弱きデジモンたちをいけにえとしてミレニアモンにささげているメフィスモン。その暴挙を止めようとしたガブモンが敵に捕らわれてしまった。いまだ太一たちと合流できていないヤマトは、偶然現れた丈とゴマモンと共にガブモンの救出作戦を敢行する。断崖絶壁の頂上に捕らわれたガブモンを助ける方法はただ一つ、ヤマトが自分自身で危険な崖を登っていくことだ。崖を監視するサラマンダモンやメフィスモンの呪文攻撃にさらされるヤマト。そんな彼の体を動かすものは、初めてガブモンと出会った時の記憶だった。
旅を続ける太一たち。だが食料探しに出掛けた時、太一と空の二人は川に落ち、そのまま流されてしまう。着いた所には、なんと、ゴーレモンや大勢のゴツモンを従えたミミが居た。ミミの話によると、恐ろしいデジモンが、平和に暮らしていたゴツモンの仲間たちを無理やり鉱山で働かせ、掘り出した宝石を独り占めしているのだという。そんなの絶対に許せないと怒り心頭のミミ。結局、太一と空はミミのペースに巻き込まれ、恐ろしいデジモンが支配するという要塞（ようさい）へ攻め込むことになるのだが…。
ISS国際宇宙ステーションの東京直撃が刻々と迫る中、光子郎はその回避策をついに発見した。ゆがんだ空間に存在する特異点から落下中のISSを狙撃すればその軌道を変える事ができるかもしれないのだ。だがそのチャンスはただ一度。太一たちと合流した光子郎は、一か八か異空間通しの狙撃という難しい作戦に皆で挑んでいく。しかし特異点に至る上空では敵の攻撃が激しさを増し、タイムリミットの迫る中で彼らは進退きわまる。「光子郎、お前が狙撃するんだ！」。全ては光子郎に託されたのだが、果たして…。
マリンエンジェモンに教えられたルートに従い、海底をファーガに向かう太一たち。海底洞窟では機雷のように相手に取り付いて爆発するチクリモンと、凶暴なエビドラモンが襲い掛かってくる。なんとか洞窟を抜けると、そこには半壊した古代の遺跡のような「見捨てられた砦（とりで）」がそびえ立っていた。立ちこめる黒い霧の中から太一たちを狙う何者かの攻撃。そしてテイルモンに「闇に落ちよ」と呼び掛ける声。砦の最深部で待ち受けていたのは恐ろしい敵、マリンデビモンであった。一方現実の世界では、国際宇宙ステーションの東京への落下が始まっていた。
ついに、8人の選ばれし子どもと8体のデジモンがそろった。目覚めたテイルモンはヒカリを守るナイトのように振る舞い、コモンドモンにも一刻も早くミレニアモン封印の地ファーガへ向かうように指示する。ファーガへと急ぐコモンドモンは、激しい海流に乗って海中を移動する。その途中、彼らはマリンエンジェモンと水生のデジモンが暮らす巨大な水中都市を訪れた。水中都市にもまた、危機が迫っていたのである。ミレニアモン復活の兆しが、デジモンたちを凶暴化させていたのだ。
もう一体の聖なるデジモンのパートナー・ヒカリをダークナイトモンから取り戻すため、太一の戦いは続く。ようやくヒカリとダークナイトモンとの再会を果たし、太一は戦いを挑む。だがヒカリは太一が助けようと伸ばした手をとることなく、まるで自らの意志のようにしてダークナイトモンの体内に取り込まれていったのである。ヒカリはなぜ、太一の手をとらなかったのか。その目的は何か。ついに打倒ミレニアモンに向けて、事態は大きく動き出す。
1体のファングモンに追われ広い草原の真っただ中を逃げていたタケルとパタモンは、コモンドモンに乗って合流した太一たちに助けられた。パタモンは、ダークナイトモンとの戦いで消耗し、エンジェモンに進化できないという。だが、コモンドモンに乗り再び出発した彼らに、2体のファングモンを従えた巨大なケルベロモンが襲い掛かる。ファングモンたちの素早い移動攻撃と、ケルベロモンの放つすさまじい威力のヘルファイアーにさらされた太一たちは、コモンドモンを爆走させなんとか振り切ろうとし、メタルグレイモンとガルダモンも敵に立ち向かうが有効な手立てがない中、次第に絶体絶命のピンチに追い込まれていく。その時、タケルとパタモンは…！
ウォーグレイモンへの究極進化は、ロップモンが自ら閉ざしていた古代の記憶の封印を解くこととなった。かつて、光の軍勢を率いたロップモンによって語られたのは、古代の戦争において猛威を振るった闇の軍勢の最終兵器・邪悪で強大なデジモン「ミレニアモン」の脅威だった。聖なるデジモンと究極体6戦士によって倒したものの、今また復活しつつあるというのだ。復活を阻止すべく、太一たちの新たな戦いが始まる。
平和に暮らしていたウッドモンたちを引き連れ、太一たちらは焼かれたジャングルを脱出する。だが、残った敵が追撃を仕掛けてくる。一同を安全に逃がすために、太一とメタルグレイモンは、自らオトリになる決意を固める。太一とメタルグレイモンは敵を自分たちの方へと引き付けるが、そこに新たな敵・パロットモンが出現。なんとか互角の戦いを演じるが、パロットモンは上空からの黒い稲光を受けて、究極体であるクロスモンへと進化する。
エンジェモンとダークナイトモンの激闘の影響で離ればなれになってしまった子どもたちは合流を目指して進んでいた。スカルナイトモンに連れ去られたヒカリを追ってジャングルに踏み入った太一とアグモンは、戦いを好まないウッドモンたちに遭遇する。そこに凶暴なタンクドラモンに率いられたアロモンやメガドラモンが襲撃、ジャングルは炎に包まれる。ジャングルにすむデジモンたちを救うためにタンクドラモンの軍団に立ち向かう太一とアグモン。大軍勢を相手に苦戦する太一たちの元へ駆け付けたのは空とピヨモンだった――。
ダークナイトモンの攻撃から仲間たちを守るため、パタモンはついに聖なるデジモン・エンジェモンへと進化した。エンジェモンはかろうじて仲間たちをその場から転移させたが、なんと太一たちは大陸のあちこちに散り散りになってしまった！ 全員の終結を目指して動き出す仲間たち。しかし彼らはそれぞれ凶悪なデジモンたちとの戦いに巻き込まれていく。現実の世界でもロケットの爆発事件以降、情報が錯綜してネットワークに大きな力を引き起こしていた。事態を解決するため、太一たちは動き出す。
